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Modal window é uma janela que você pode mostrar notícias, textos, etc no navegador.
Não como uma nova janela; e sim através de um div (veja imagem abaixo).
Utiliza HTML, CSS e jQuery.

http://dev.iceburg.net/jquery/jqModal/

Simples plugin para Tooltip com jQuery.

http://bassistance.de/jquery-plugins/jquery-plugin-tooltip/

Sensacional solução de tooltip com jQuery. Flexível e customizável.

http://codylindley.com/Javascript/264/jtip-a-jquery-tool-tip

ThickBox é um widget escrito em JavaScript com jQuery. Pode mostrar num div uma imagem, múltiplas imagens, conteúdo normal ou de um servidor com Ajax.

http://jquery.com/demo/thickbox/

Um excelente ticker com jQuery. Simples e eficiente.
http://www.texotela.co.uk/code/jquery/newsticker/

Aplicação interessante que trata de setTimeout e setInterval de uma maneira diferente.  Combina JQuery para gerar um sistema de eventos a cada período de tempo.
http://jquery.offput.ca/every/

Outro menu pra quem gosta de MAC OS. Um plugin com jquery que permite construir esse tipo de menu.
http://icon.cat/wiki/IconDock_En#iconDock_jQuery_Plugin

Aplicação muito útil em algumas ocasiões: serve pra criar uma sequência (passo 1, passo 2, etc) .
Esse sistema foi baseado nesse trabalho:
http://codylindley.com/CSS/325/css-step-menu
Como um plugin, agora o jquery:
http://worcesterwideweb.com/2007/06/04/jquery-wizard-plugin/

Menu com abas como o da figura abaixo. Utiliza javascript e css.

http://www.stilbuero.de/jquery/tabs/
É possível colocar efeitos (slide, fade, etc); animações, ajax, desativar e ativar abas. Muito fácil de entender e utilizar.
JQuery website: http://jquery.com/

Se você é fã de MAC, provavelmente vai adorar esse menu.
Utiliza Jquery e o componente fisheye. Vem com dois estilos para configurar; no topo ou no rodapé da página.

http://www.ndesign-studio.com/blog/mac/css-dock-menu